Para reservar pasajes de todo tipo para llegar / salir de Kho Samui, recomiendo la página 12go.asia.com. Yo la he usado un montón de veces. Es súper simple, online, en diferentes idiomas y nunca tuvimos ningún problema. 

Desde Bangkok. 

1. Avión. La opción obviamente más rápida y cómoda. Hay vuelos diarios en Bangkok Air y en muchísimos horarios que aterrizan en Kho Samui. Tardan 1h 10m y cuestan 70 USD apróx. 

2. Bus. Buses nocturnos con destino a Surat Thani. Luego te llevan en minivan hasta el embarcadero donde te tomarás un ferry hasta la isla. El valor total aproximado es entre 30 y 40 USD por todos los trayectos y el tiempo estimado son de 14 horas apróx. No te preocupes por los transbordos, el turismo en Tailandia está bien desarrollado y se ejecuta de una manera bastante seria y responsable. No deberías tener mayores problemas. 

Desde Kho Tao o Kho Phangan

1. Ferry. Hay todos los días durante las mañanas y las tardes. Entre Kho Tao y Kho Samui su valor es de 20 USD (menores de 2 gratis, hasta 7 años 10 USD) y tarda 2 h. Entre Kho Samui y Koh Phangan el valor es de 9 USD y demora 45m en llegar. 

Desde Krabi 

1. Avión. Hay vuelos en Bangkok Air que cubren la ruta. Tienen un valor de 120 USD apróx y tardan 50 minutos. 

2. Bus. Hay opciones de bus+ferry rápido en 4 horas apróx por 40 USD. La opción lenta de 6-7 horas cuesta 20 USD apróx. 

Desde Phuket

1. Avión. Hay vuelos en Bangkok Air que cubren la ruta. Tienen un valor de 120 USD apróx y tardan 55 minutos. 

2. Buses. La opción bus+ferry tarda entre 6 y 8 horas aproximado, y tiene un valor de entre 20 y 40 USD según las elecciones que vayas tomando. Dependerá del tipo de bus (VIP o Express), y también si eliges lancha rápida o no para cruzar hacia la isla.